培養(yǎng)基配制完畢后，應立即滅菌。培養(yǎng)基通常應在高壓蒸汽滅菌鍋內，在汽相120℃條件下，滅菌20分鐘。如果沒有高壓蒸汽滅菌鍋，也可采用間歇滅菌法進行滅菌，即將培養(yǎng)基煮沸10分鐘，24小時后再煮沸20分鐘，如此連續(xù)滅菌三次，即可達到完全滅菌的目的。
經過滅菌的培養(yǎng)基應置于10℃下保存，特別是含有生長調節(jié)物質的培養(yǎng)基，在4～5℃低溫下保存要更好些。含吲哚乙酸或赤霉素的培養(yǎng)基，要在配制后的一周內使用完，其它培養(yǎng)基最多也不應超過一個月。在多數(shù)情況下，應在消毒后兩周內用完。